• The genomic basis of the plant island syndrome in Darwin’s giant daisies 

      Cerca, José; Petersen, Bent; Lazaro-Guevara, José Miguel; Rivera-Colón, Angel G.; Birkeland, Siri; Vizueta, Joel; Li, Siyu; Li, Qionghou; Loureiro, João; Kosawang, Chatchai; Jaramillo Díaz, Patricia; Rivas-Torres, Gonzalo; Fernández-Mazuecos, Mario; Vargas, Pablo; McCauley, Ross; Petersen, Gitte; Santos-Bay, Luisa; Wales, Nathan; Catchen, Julian M.; Machado, Daniel; Nowak, Michael; Suh, Alexander; Sinha, Neelima R.; Rostgaard Nielsen, Lene; Seberg, Ole; Gilbert, Marcus Thomas Pius; Leebens-Mack, James H.; Rieseberg, Loren H.; Martin, Michael David (Peer reviewed; Journal article, 2022)
      The repeated, rapid and often pronounced patterns of evolutionary divergence observed in insular plants, or the ‘plant island syndrome’, include changes in leaf phenotypes, growth, as well as the acquisition of a perennial ...
    • Metabolic memory underlying minimal residual disease in breast cancer 

      Shechter, Ksenija Radic; Kafkia, Eleni; Zirngibl, Katharina; Gawrzak, Sylwia; Alladin, Ashna; Machado, Daniel; Lüchtenborg, Christian; Sévin, Daniel C.; Brügger, Britta; Patil, Kiran R.; Jechlinger, Martin (Peer reviewed; Journal article, 2021)
      Tumor relapse from treatment-resistant cells (minimal residual disease, MRD) underlies most breast cancer-related deaths. Yet, the molecular characteristics defining their malignancy have largely remained elusive. Here, ...
    • Metabolic network layout using biochemical coordinates 

      Lien, Martin (Master thesis, 2022)
      De kjemiske egenskapene til molekyler er preget av numeriske verdier kjent som molekylære deskriptorer og beregnes fra molekylære representasjoner i kjeminformatiske verktøy. Ulike molekylære deskriptorer brukes for å ...
    • Predicting Allosteric Regulation at Genome Scale 

      Røed, Elin Sandertun (Master thesis, 2023)
      Celler administrerer et ubegripelig antall reaksjonsveier og reaksjoner for å holde seg i live. For å sikre korrekt produksjon av reaktanter for de aktuelle forholdene er cellen avhengig av å regulere proteinaktivitet. ...
    • Predicting metabolic fluxes from gene expression data using machine learning 

      van Eggelen, Marieke Cecilia (Master thesis, 2023)
      Ved å omprogrammere metabolismen til mikroorganismer kan de gjøres om til effektive fabrikker for produksjonen av ønskede metabolitter. Dette innebærer imidlertid tids- og kostnadskrevende eksperimenter, og siden ...
    • Towards genotype—phenotype association: leveraging multiple-source microbial data and genome annotations to infer trait attributes for the uncultured microbiome 

      Merkesvik, Jenny (Master thesis, 2022)
      Mikroorganismer har blitt studert helt siden mikroskopet ble oppfunnet. Mikrober er svært viktige for mennesket, enten vi velger å bruke dem innen grunnforskning, industri og matproduksjon, eller om de er en obligatorisk ...
    • Unlocking the genomic potential of aerobes and phototrophs for the production of nutritious and palatable microbial food without arable land or fossil fuels 

      Alloul, Abbas; Spanoghe, Janne; Machado, Daniel; Vlaeminck, Siegfried E. (Peer reviewed; Journal article, 2021)
      The increasing world population and living standards urgently necessitate the transition towards a sustainable food system. One solution is microbial protein, i.e. using microbial biomass as alternative protein source for ...